여의도순복음교회는 미전도 종족 및 제3세계 원주민 사역에 집중한다는 계획을 가지고 원주민 목회자 양성을 위한 신학교 육성을 더욱 강화할 것이다. 현재 9개국에 있는 신학교 각각의 상황에 맞추어 선택과목을 개설하고 오중복음 삼중축복, 4차원의 영성을 공통필수 과목으로 지정하여, 교안 매뉴얼을 작성하고 한국어와 현지어로 보급할 계획이다. 현재 공통필수 과목 중 현지사정상 강의가 어려운 과목에 대해서는 신학교 강화를 위해 본교에서 최소 1인 이상 순환 강사를 파견해 집중 강의를 하고 있다.

현재 교민 교회는 교민을 중심으로 사역을 하고 있다. 향후 교민 교회는 교민목회와 더불어 원주민사역의 전초 기지로서 역할을 감당할 것이다. 원주민 교회 지원 확대 및 신학교 지원 사역으로 더욱 사역을 확대하여 원주민교회 사역과 더불어 신학교 사역 지원으로 폭을 넓혀 갈 것이다.

여의도순복음교회는 매년 여름 월드미션이란 이름으로 800여명의 청년들이 전 세계를 향해 2~4주간 단기선교를 하고 있다. 이들의 선교사역은 선교지의 양적부흥과 영적부흥에 큰 역할을 감당했다. 이러한 사역을 장년으로 확대하고, 더 나아가 전성도로 확장하여 나갈 것이다. 그리고 선교사의 협력 사역을 담당하고 있는 현지의 선교사 자녀, 해외유학생, 교포2세 및 원주민 사역자를 대상으로 성령캠프를 진행하여, 성령운동의 중심지인 여의도순복음교회의 신앙과 신학 및 성령운동의 전통을 전 세계 청년들에게 전한다는 계획을 가지고 있다. 년2회 진행될 성령캠프중 상반기는 현지 사역 담당자를 국내로 초청할 계획이고, 하반기에는 확대된 청,장년 선교팀이 현장으로 나가 성령의 불을 현지에 타오르게 할 것이다.